机械化帝国是一个不重视生命的机械帝国，首领是机械神，以攻占星球并把其机械化为已任。而除了地球，包括月球在内，整个太阳系已被机械化了。　　峰崎拳一，立花浩美和朝冈忍子春风校园六年级生。就在他们回校参加开业礼时，机械化帝国的第一机械王齿车王开始攻击地球。就在峰崎拳一等人快要受袭，守卫地球的艾度兰打开一个时空裂缝，三人回到六千四百万年前的世界。这时光之人艾度兰已经差不多耗尽所有能量，于是他把三只恐龙...

奇力男谢洛（森久保祥太郎 配音）自幼失去了双亲，沦为孤儿，在孤儿院过着孤苦伶仃的生活。期间，他结识了名为阿丽莎（筱原惠美 配音）的女孩，两人相依为命，共同来到牙之塔学习黑魔法。实际上，奇力男谢洛一直默默的爱慕着阿丽莎，可是，在阿丽莎的眼中，奇力男谢洛仅仅是一个需要她照顾的弟弟一般的存在。　　阿丽莎喜欢的，是她的老师查尔德曼（中田让治 配音），然而，查尔德曼却拒绝了阿丽莎的表白。伤心之中，阿丽莎开始...

运动万能、拥有正义感，在班上最受欢迎的美墨莎莎。成绩优秀，永远是班上的第一名，但其实有点天真的雪城乃香，两人同是就读菲诺奈学院女子中学部二年级的学生。某一天，莎莎和乃香各自遇见了不可思议的神奇生物美波和米波，他们由于故乡光之园遭到邪恶的攻击，因而逃到虹之园来。 　　然后，莎莎和乃香被美波和米波赋予神奇的力量，携手变身成光之美少女“Pretty Cure”。 　　性格和兴趣都完全相反的两个人将同心协...